Η διάτρηση στομάχου (ή διάτρηση του γαστρεντερικού σωλήνα) συμβαίνει όταν δημιουργείται μια τρύπα στο στομάχι, ή στο παχύ, ή στο λεπτό έντερο.
Η διάτρηση στομάχου είναι μια ιατρική κατάσταση που απαιτεί άμεση ιατρική περίθαλψη, καθώς είναι απειλητική για τη ζωή του ασθενούς. Οι πιθανότητες ανάκτησης βελτιώνονται με έγκαιρη διάγνωση και θεραπεία.