Από τις έρευνες των αρχών προέκυψε πως η Στοά δεν κατέβαλε ΦΠΑ και ότι δεν είχε εκδώσει ούτε καν ΑΦΜ!
Επιπλέον η οικονομική αστυνομία που διενήργησε τον έλεγχο διαπίστωσε διαρροές δύο εκατομμυρίων ευρώ κατά τη διάρκεια των ετών 2006-2015.
Η διερεύνηση της υπόθεσης ξεκίνησε από μέλος της Τεκτονικής Στοάς που έκανε λόγο για παρατυπίες στη διαχείριση των συνδρομών των μελών. Μάλιστα σύμφωνα με πληροφορίες το ΣΔΟΕ προχώρησε στον άμεσο καταλογισμός απόδοσης ΦΠΑ ύψους 28.000 ευρώ.